Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC1BO15143 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms