Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QRK9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QRK9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QRK9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QRK9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms