Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRDCB7Z8K6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms