Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L5A6NJ08 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L5A6NJ08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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