Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD3L4A6NDZ8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD3L4A6NDZ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms