Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF22A3QJZ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms