Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms