Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIAS3Q9Y6X2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIAS3Q9Y6X2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms