Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SNX13Q9Y5W8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SNX13Q9Y5W8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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