Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms