Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms