Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms