Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms