Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms