Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms