Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms