Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms