Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L1Q9NU39 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L1Q9NU39 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms