Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN4Q9NRL3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN4Q9NRL3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms