Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms