Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms