Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6CQ9HCJ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms