Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms