Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SENP3Q9H4L4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms