Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMBRA1Q9C0C7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms