Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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