Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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