Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GSDMCQ9BYG8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GSDMCQ9BYG8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms