Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC4A5Q9BY07 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms