Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms