Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms