Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FYCO1Q9BQS8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms