Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms