Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SPOCK3Q9BQ16 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SPOCK3Q9BQ16 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SPOCK3Q9BQ16 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SPOCK3Q9BQ16 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SPOCK3Q9BQ16 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK3Q9BQ16 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms