Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms