Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms