Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms