Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC43Q96MW1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms