Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC17Q96LX7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms