Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPNS2Q96L46 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAPNS2Q96L46 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms