Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRIG1Q96JA1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms