Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TPD52L3Q96J77 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms