Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM52Q96A61 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms