Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKD1Q969G9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms