Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAVIN3Q969G5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms