Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF4BQ92750 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms