Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSRNP3Q8WYN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms