Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NUP35Q8NFH5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NUP35Q8NFH5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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