Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms