Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms